组织微环境研究的一个关键问题，是细胞之间的距离是否承载生物学信息。《Cell》发表的胶质母细胞瘤（GBM）空间多组学研究提供了一个清晰案例：研究者不仅观察T细胞是否增多，还进一步追问GZMB+ CD8+ T细胞是否靠近发生凋亡的肿瘤细胞，以及这种邻近关系是否对应不同的空间功能区。空间蛋白组学的优势正体现在这里，它可以在FFPE组织切片中保留肿瘤实质、淋巴聚集区、血管周围区和坏死周围区的原始结构。PCF80作为80抗体Panel空间单细胞蛋白组体系，可用于扩展类似的细胞邻域研究。
在GBM中，免疫细胞是否出现在组织内并不能直接说明其功能。T细胞可能位于淋巴聚集区，也可能靠近肿瘤细胞，还可能被缺氧或坏死相关结构隔开。文献利用空间分析识别出肿瘤-T细胞界面、淋巴聚集区、血管周围区、坏死周围区等功能不同的区域。研究发现，肿瘤-T细胞界面中的T细胞更高表达GZMB，而淋巴聚集区中的T细胞更高表达Ki67。也就是说，空间区域本身会影响我们对T细胞状态的解读，不能把所有T细胞平均化处理。
PCF（CODEX）空间单细胞蛋白组在该研究中提供了蛋白层面的邻域证据：GZMB+ CD8+ T细胞与cl-Casp3+肿瘤细胞紧密相邻；靠近T细胞的肿瘤细胞高表达cl-Casp3、CLEC2D和MHC-I，而远离T细胞的肿瘤细胞高表达CA9。Xenium则从转录层面补充了空间梯度，显示靠近肿瘤细胞的T细胞富集组织驻留、细胞毒性和干扰素反应基因，距离增加后干细胞样特征增强。若用PCF80设计文章或课题，可围绕T细胞毒性、肿瘤凋亡、免疫逃逸、抗原呈递、缺氧和增殖等蛋白指标搭建肿瘤-T细胞界面分析框架。
这一空间微环境角度可用于多种科研场景。在肿瘤免疫研究中，可分析T细胞与肿瘤细胞的最近距离、接触频率和接触区域蛋白状态；在缺氧微环境研究中，可比较CA9高表达区域与T细胞排斥区域是否重叠；在神经肿瘤研究中，可把GFAP+肿瘤实质、血管内皮、髓系细胞和坏死周围结构纳入统一空间图谱；在炎症研究中，也可借鉴邻域方法观察效应细胞与靶细胞的空间耦合。PCF80的意义在于帮助研究者把“相邻”转化为可量化的细胞邻域指标。
从这篇Cell研究可以看到，空间蛋白组学不仅是多标志物染色，更是对组织结构中细胞行为的定量描述。GZMB+ T细胞和cl-Casp3+肿瘤细胞的邻近关系，展示了蛋白状态与空间距离结合后能够产生新的机制线索。PCF80可在更高通量Panel中延展这类分析，用于探索细胞邻域、功能分区和组织微环境重塑。
【说明】本文仅为科研技术方法介绍，不涉及疾病诊断、治疗建议或用药指导。文中提及的研究发现均来自学术文献，不构成任何医疗意见。如有健康问题，请咨询专业医疗机构。
【参考文献】Meylan M, Tian Y, Wu L, Ling AL, Kovarsky D, Barlow GL et al. Persistent T cell activation and cytotoxicity against glioblastoma following single oncolytic virus treatment in a clinical trial. Cell. 2026:S0092-8674(25)01504-1. 来源于原始文献资料。